Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK4P11802 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK4P11802 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK4P11802 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK4P11802 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK4P11802 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK4P11802 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK4P11802 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK4P11802 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK4P11802 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK4P11802 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms