Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGF3P11487 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGF3P11487 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF3P11487 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGF3P11487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGF3P11487 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF3P11487 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF3P11487 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF3P11487 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF3P11487 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGF3P11487 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGF3P11487 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGF3P11487 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGF3P11487 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGF3P11487 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGF3P11487 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGF3P11487 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms