Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA2P0DJI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms