Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACAA1P09110 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACAA1P09110 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms