Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms