Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAPBO95292 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAPBO95292 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAPBO95292 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPBO95292 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPBO95292 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPBO95292 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPBO95292 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPBO95292 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPBO95292 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPBO95292 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPBO95292 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPBO95292 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms