Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUTAO60888 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUTAO60888 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUTAO60888 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUTAO60888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUTAO60888 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUTAO60888 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUTAO60888 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUTAO60888 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUTAO60888 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUTAO60888 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUTAO60888 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUTAO60888 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms