Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMFO60524 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMFO60524 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEMFO60524 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEMFO60524 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEMFO60524 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEMFO60524 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEMFO60524 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms