Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms