Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3O43889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3O43889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3O43889 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB3O43889 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3O43889 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3O43889 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms