Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN4O43707 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms