Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRY3O43610 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPRY3O43610 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPRY3O43610 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms