Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI3O43414 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERI3O43414 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERI3O43414 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI3O43414 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI3O43414 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI3O43414 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERI3O43414 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERI3O43414 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms