Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EEF1E1O43324 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms