Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1CO15160 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms