Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC01387J3KSC0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms