Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB8E9PQR5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB8E9PQR5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms