Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms