Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL13PA6NNM8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms