Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC182A6NF36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC182A6NF36 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms