Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L3A6NEY3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms