Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6BA6NDN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms