Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms