Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms