Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX3P78415 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX3P78415 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX3P78415 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX3P78415 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX3P78415 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX3P78415 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRX3P78415 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms