Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms