Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms