Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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