Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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