Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAMP1Q96JM3 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms