Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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