Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms