Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms