Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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USP35Q9P2H5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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