Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms