Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ZNF827Q17R98 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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