Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms