Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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