Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAEP38570 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms