Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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