Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGS1P23219 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms