Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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