Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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