Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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