Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP7P55210 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP7P55210 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms