Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DMDP11532 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC073592.1-201ENST00000543970 1282 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
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