Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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