Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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