Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms