Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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